目前针对妊娠期合并甲亢的妊娠孕妇，治疗方式主要有四种，合并何治即抗甲状腺药物治疗、甲亢键手术治疗、治多种放射性I131以及中药治疗等，疗分疗用考虑到孕妇和胎儿的药关的健康，一般建议是妊娠通过药物调整，以保证孕妇平安度过孕期以及分娩为原则，合并何治采取中西结合的甲亢键用药方式是为首选。
很多女性在备孕时做妊娠合并甲亢检查时发现有此类病症，那么一般建议先用药控制，疗分疗用病情稳定后再备孕，药关具体的妊娠治疗手段包括RAI（碘131）治疗、ATDs（抗甲状腺药物）治疗、合并何治手术治疗，甲亢键每一种各有其优缺点，具体如下：
| 治疗方法 | 优点 | 缺点 |
| RAI治疗 | 治疗简单，停止或修改容易，可减少甲状腺肿 | 需要重复治疗，可能引起抗体升高，增加胎儿风险 |
| ATDs治疗 | 1~2个月内使甲功有效恢复正常，使免疫性疾病逐渐缓解 | 药物存在不良反应，停药后复发率约50~70% |
| 手术治疗 | 甲亢的确切疗法，解除甲状腺肿 | 需终身L-T4替代治疗，手术并发症约2~5%，永久的颈部瘢痕 |
再妊娠早期首选的治疗药物为丙基硫氧嘧啶，在妊娠中期和晚期则应该选用甲巯咪唑治疗，或者丙基硫氧嘧啶，其中药是因为在怀孕的早期，如果使用甲巯咪唑可能会引起胎儿头皮缺陷。
对于使用抗甲状腺药物治疗剂量不应过大，一般临床上剂量为丙基硫氧嘧啶150～300mg/d，或者他巴唑15～30mg/d，用药期间定期检查，如果妊娠合并甲亢得到有效控制，可适量减少剂量。
当患者依靠最小剂量的抗甲状腺药物维持甲功正常数周后，可以停药，但为了避免复发，目前多主张维持治疗至妊娠32周后。
另外还需要主要的是，如果孕妇处于预产期的前2～3周，那么不建议用药或者使用控制甲亢的最小有效量，一般剂量选择为丙基硫氧嘧啶每天保持200mg以下，他巴唑在20mg以下，这样胎儿发生甲状腺肿的可能性极小。
除了以上的两种药物，临床上还使用普萘洛尔，其对甲亢孕妇也是一种有效的治疗药物，不仅能有效缓解甲状腺激素过多引起的全身心症状，病情其效果较好、作用快，适用于甲亢危象和施行紧急甲状腺手术的快速准备。
除了药物控制，还可以通过手术和放射性I131来治疗，不过考虑到孕妇和胎儿健康，手术治疗应当慎之又慎，一般只有满足下述情况才考虑手术的方式：
由于在孕早期或者晚期进行手术容易引发胎儿流产或早产，因此手术的时机一般选择为孕中期，也就是妊娠4～6个月左右为最佳。
而对于放射性I131治疗，孕妇是禁止用此种方式的，因为放射性碘剂可通过胎盘进入胎儿的甲状腺，破坏胎儿的甲状腺，引发甲状腺肿大及甲减等症状。
很多孕妇存在一个误区，那就是认为妊娠合并甲亢可通过中药来治疗，然后事实上恰恰相反，中药对于治疗此类疾病效果非常差，临床上也不推荐使用任何的中药来治疗。
总的来说，患有此类病症的孕妇除了积极配合医生用药治疗，在日常生活中也要注意，妊娠合并甲亢的护理工作一定要做好，对于待产的孕妇，一定要做好针对甲亢危象的处理准备。
